Η συνεχής ανάπτυξη της επιστήμης της Χημείας αλλά και των άλλων συναφών επιστημών καθιστούν αναγκαία την κατά καιρούς αναμόρφωση του προγράμματος σπουδών του Τμήματος. Αυτό γίνεται είτε με προσθήκη νέων μαθημάτων είτε με τροποποίηση του περιεχομένου της ύλης διδασκομένων μαθημάτων. Στα πλαίσια του προγράμματος ΕΠΕΑΕΚ «Αναμόρφωση Προγράμματος Προπτυχιακών Σπουδών Τμήματος Χημείας» έγινε εισαγωγή νέων μαθημάτων, αναβάθμιση των εργαστηρίων και εισαγωγή στα διάφορα μαθήματα και εργαστήρια της Πράσινης Χημείας (Green Chemistry). Το παρόν πρόγραμμα σπουδών διαμορφώθηκε στην συνεδρίαση 7/28-6-2005 της Γενικής Συνέλευσης του Τμήματος Χημείας.